卵巢囊肿分为良性囊肿和恶性肿瘤。卵巢恶性肿瘤一经发现，建议及早手术治疗，不建议口服药物治疗。卵巢良性囊肿多为卵巢瘤样病变，若肿块小于5cm，可作短期观察，可有酌情配合使用中成药物治疗（如桂枝茯苓胶囊、散结镇痛胶囊等），一经确诊为良性肿瘤，应手术治疗，根据患者年龄、生育要求及对侧卵巢情况决定手术范围。
