感觉阴茎里面隐隐的痛,有如下几种可能性:一是有结石,是从肾输尿管、膀胱掉到了尿道,就会刺激尿道而引起疼痛。二是尿路感染,如尿道炎,男性往往都是一些特异性的感染,如淋球菌、支原体、衣原体的感染,多数是不洁的性交引起的,常有尿道痛痒、灼热症状。三是存在较重的前列腺炎,或急性前列腺炎,也会引起尿道痛。如果分不清是结石、尿道炎,还是比较重的前列腺炎等,有异常症状的应及时就医检查,然后进行有针对性的治疗。