女性B超检查和阴超检查各有优缺点，要根据被检查女性的情况而决定选用哪种检查。B超主要是隔着肚皮通过超声波检查，可以检测女生阴道子宫及附件，需要憋尿，而阴超是探头通过阴道进去，从阴道内或子宫内窥视女性生殖器内部情况，无需憋尿。故而，对于膀胱无法或不适合憋尿的、女性阴道流血、较重炎症、女性尚是处女等各种不利于探头进入阴道的情况下，应优先考虑使用B超检查。而对于某些B超隔着肚皮检测效果不良好的疾病，比如性病、尖锐湿疣等，需探头进入阴道窥视的疾病，则优先考虑使用阴超检查。
