治疗滴虫性阴道炎的首选药物是甲硝唑和替硝唑等硝基咪唑类药物，全身用药效果最佳，通常采用单次大剂量或7日疗程方案，局部用药可作为辅助治疗。
甲硝唑作为最常用的治疗药物，成人单次口服2g或500mg每日两次共7天，替硝唑单次口服2g疗效相当，也可选择奥硝唑等同类药物，这些药物通过干扰滴虫的DNA合成达到杀灭效果，临床治愈率可达90%以上。局部用药如甲硝唑凝胶、阴道泡腾片等可作为辅助治疗，特别适用于症状严重或不能耐受口服药物的患者，但单纯局部用药效果不如全身用药，建议两者联合使用以提高治愈率。治疗期间必须完成整个疗程，即使症状提前消失也不能停药，以免滴虫产生耐药性导致复发，同时性伴侣应同时接受治疗，即使没有症状也需进行检查和预防性用药，治疗期间应避免性生活，使用避孕套也不能完全防止传播，还需注意个人卫生，勤换内裤，避免共用浴巾等物品，症状严重或复发时应及时就医，医生可能会调整用药方案或延长疗程。
日常生活中应注意保持外阴清洁干燥，选择透气性好的棉质内裤，避免穿紧身不透气的裤子，月经期间勤换卫生巾，避免使用刺激性强的洗液清洗阴道，清水清洗即可，饮食上应避免辛辣刺激性食物，保持规律作息，增强免疫力，定期进行妇科检查，及时发现和治疗其他妇科疾病，预防交叉感染。
