噬血细胞综合征的治愈率存在较大差异，总体治愈率在30%-70%之间，部分患者经规范治疗可获得长期缓解。具体治愈率受疾病分型、治疗时机及个体差异影响明显。
该疾病分为原发性和继发性两类，原发性多由遗传基因突变导致，病情较重，通常需通过造血干细胞移植实现长期生存，移植后5年生存率可达50%-60%；继发性则多由感染、肿瘤等因素诱发，若能及时控制原发病，治愈率可提升至50%-70%，其中感染相关型通过早期免疫调节治疗，缓解率较高，而肿瘤相关型预后相对较差。
治疗时机对生存率至关重要。早期确诊并接受规范治疗的患者，5年生存率可达55%-70%，而延迟治疗可能导致多器官功能衰竭，生存率明显下降。此外，年龄因素也影响预后，儿童患者对化疗敏感性较高，治愈率可达50%-70%，成人患者尤其是合并基础疾病者，预后较差，治愈率降至30%-40%。
治疗过程中需密切监测并发症，如中枢神经系统受累或弥散性血管内凝血，这些并发症会明显增加死亡率。患者需定期复诊，检查肝肾功能、凝血功能等指标，以便及时调整治疗方案。
