核磁共振检查通常对身体无害。
其成像原理基于磁场和射频波激发人体内氢原子核，不涉及电离辐射，因此不会像X光或CT检查那样对细胞造成辐射损伤。检查过程中，人体虽处于强磁场环境，但该磁场不会破坏细胞结构或干扰正常生理功能，射频波的能量也极低，不会产生累积性热效应。
不过，部分特殊人群需谨慎评估检查风险。例如，体内装有心脏起搏器、人工耳蜗等金属植入物的患者，磁场可能干扰设备功能或导致金属移位，需提前告知医生并评估检查可行性；妊娠早期女性若无明确医学指征，通常避免接受检查以规避潜在未知影响；幽闭恐惧症患者可能因检查舱的密闭环境产生焦虑，可通过开放式设备或镇静剂缓解。
此外，极少数情况下，患者可能对检查中使用的对比剂（如含钆制剂）产生过敏反应，表现为皮肤瘙痒、呼吸困难等，但发生率极低，医生会在检查前详细询问过敏史并做好应急准备。检查时机器产生的噪音可能引起短暂耳鸣或不适，佩戴耳塞即可有效防护。
