紧急避孕药的药效主要取决于所服用的具体药物类型，但一般来说，单次剂量的紧急避孕药在体内的活性可持续约24-72小时，而其对排卵的抑制作用可持续约5-7天。
紧急避孕药的活性持续时间与其提供的避孕保护时间并不完全一致，药物活性是指药物在体内保持有效浓度的时间，而避孕保护则是指药物能够成功阻止怀孕的时间窗口。不同类型的紧急避孕药，如含左炔诺孕酮的药物和含乌利司他的药物，其代谢途径和半衰期各不相同，前者主要通过肝脏代谢，后者则通过CYP3A4酶系统代谢，这导致它们在体内的持续时间有所差异。个体差异也是一个重要因素，包括年龄、体重指数、肝功能状况以及肠道吸收效率等都会影响药物在体内的存留时间。服用时间与药效密切相关，越接近无保护性行为后服用，效果越好，但药效持续时间不会因此改变。激素水平变化方面，紧急避孕药通过抑制或延迟排卵、改变宫颈粘液和子宫内膜状态来发挥作用，这些激素效应通常在服药后几天内达到峰值。紧急避孕药只能提供一次性行为的保护，之后需要采取其他避孕措施，其副作用如恶心、乳房胀痛等通常在24-48小时内缓解，而月经周期变化可能持续到下一个周期。某些药物如抗癫痫药、抗生素等可能与紧急避孕药发生相互作用，降低其效果。
服用紧急避孕药后，应密切观察身体反应，如出现严重不适如异常阴道出血、严重腹痛或视觉变化等应及时就医。同时，虽然紧急避孕药可有效降低怀孕风险，但并非100%有效，若月经推迟超过一周，应进行妊娠测试。紧急避孕药不应作为常规避孕方法使用，建议咨询医生选择适合自己的长期避孕方式，并注意在服药期间及之后一段时间内可能出现的月经周期变化。
