胚胎停止发育的主要原因包括染色体异常、内分泌失调、免疫因素、子宫解剖异常、感染、环境暴露、父亲因素以及不明原因等。
染色体异常是导致胚胎停育的最常见原因，约占早期流产的50%以上，包括染色体数目异常和结构异常。内分泌因素如黄体功能不全、甲状腺功能异常、高泌乳素血症等会影响胚胎着床和发育。免疫因素包括自身免疫性疾病和同种免疫异常，母体产生抗胚胎抗体可能导致排斥反应。生殖器官解剖异常如子宫畸形、子宫肌瘤、宫腔粘连等会影响胚胎着床和生长。感染因素如TORCH感染（弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒）可直接损害胚胎或引起宫内环境改变。环境因素包括接触有害物质、放射线、药物滥用等。父亲因素如精子DNA碎片率增高、染色体异常等也会影响胚胎质量。约50%的胚胎停育原因不明，可能与多因素综合作用有关。
备孕期间应保持健康生活方式，避免接触有害物质和放射线，合理饮食，规律作息，戒烟限酒，积极治疗基础疾病，进行孕前检查，包括染色体、内分泌、免疫等方面的评估，孕期定期产检，出现异常症状及时就医。
