输卵管切除的副作用是降低自然受孕几率，如果两侧输卵管都切除，女性会丧失自然受孕的几率。
正常女性有两根输卵管，输卵管的主要功能为捕捉卵子，输送卵子和精子，为卵子与精子的结合提供场所并将受精卵输送至宫腔。
在紧急情况下，如发生输卵管妊娠等情况必须要切除一侧输卵管时，也是可以切除的，虽然会降低怀孕几率，但是由于另外一条输卵管可以正常工作，仍然是有机会正常受孕的。
如果两侧输卵管都切除了，卵子就无法与精子结合形成受精卵，女性就无法完成自然受孕，如有生育需求，需借助试管婴儿助孕，就是人工取出卵子，在体外和精子结合后再移植到子宫内膜，存活率相比于自然受孕会低一些，受女性的年龄、激素水平、子宫内膜的容受性等影响较大。
