流脑和乙脑分别是指流行性脑脊髓膜炎和流行性乙型脑炎，其区别主要在于致病菌不同、发病的部位以及传播途径等有所不同。
1、致病菌不同：流行性脑脊髓膜炎的致病菌主要是细菌性脑膜炎球菌，而流行性乙型脑炎的致病菌主要为流行性乙型脑炎病毒。
2、发病部位不同：流行性脑脊髓膜炎主要侵犯的部位为中枢神经系统的脑膜以及脑实质，而流行性乙型脑炎侵犯的部位也是属于中枢神经系统，但主要位于大脑皮层和脑干。
3、传播途径不同：流行性脑脊髓膜炎的传播途径主要为接触传播以及飞沫传播，部分患者也可通过食物进行传播。但流行性乙型脑炎的传播途径主要为蚊虫叮咬，通过蚊虫叮咬之后，从血液当中进行传播。
除上述的区别之外，两者的流行季节以及治疗方案也有一定的区别，主要可以通过脑脊液检查等手段进行鉴别，确诊具体的类型之后再针对性治疗。
