卵黄囊和胎芽的关系就是胚胎发育的不同阶段，卵黄囊也是形成胎芽的基础。
精子和卵子相遇形成受精卵，受精卵成功着床并进一步分裂、增殖后形成妊娠囊，妊娠囊内最先出现的胚胎组织就是卵黄囊。在受精卵着床后的第3周，卵黄囊胚外中胚层形成血岛，为早期胚胎进一步发育提供造血场所。在受精后的第4周，卵黄囊内胚层顶部就会随着胚盘卷向腹侧，形成胚芽的原始消化管，之后胎芽进一步发育，卵黄囊则逐渐萎缩形成卵黄蒂。
月经周期规律的情况下，一般在怀孕35天的时候，可以通过超声检查看到妊娠囊以及妊娠囊内的卵黄囊，在怀孕42天左右的时候就可以看到胎芽，并且可以看到原始心管搏动，之后在怀孕12周之前卵黄囊都会逐渐发育、增大，胎芽也会随之进一步发育，怀孕8周后胎芽发育成胎儿，发育速度加快，12周后卵黄囊消失。
所以，卵黄囊和胎芽就是胚胎发育的不同阶段，卵黄囊也是形成胎芽的基础。
