毛囊炎与痤疮可以从病因、发病部位和临床表现等方面进行区分：
引发毛囊炎的致病菌有金黄色葡萄球菌、糠秕孢子菌等；而导致痤疮的致病菌有痤疮丙酸杆菌以及金黄色葡萄球菌等。
毛囊炎可发于毛囊分布的任何部位，头顶、面部、颈项、躯干、四肢以及外阴部位均可发病；而痤疮常见的发病部位是面部、颈项部、胸背部等。
毛囊炎临床表现为沿毛囊口分布的红斑、丘疹以及脓疱等。而痤疮表现为毛囊部位的粉刺、红斑、丘疹、脓疱、囊肿结节，后期可出现炎症后色素减退、色素脱失以及痘坑、痘印等情况。
