白血病骨髓移植后是否会复发与患者白血病的风险程度、移植前疾病的缓解状态、选择移植的具体类型、移植后的抗排异策略和移植后的白血病治疗策略等多种因素相关。
认为白血病的基因突变和染色体核型是关系预后的最主要因素。具有高危细胞遗传学预后的患者治疗效果差，移植后复发概率高。移植前的缓解深度也直接影响移植效果。移植前缓解程度越深，移植后的长期无病生存越好。自体移植和脐带血移植由于本身条件限制，移植后复发率高于骨髓或外周血的异基因移植。移植后抗排异药物使用时间一般1-2年，部分高危患者可以通过早期减停抗排异药物来达到减少复发的目的。
部分患者在移植后还可以服用一些特异性的靶向药物，进一步提高生存，减少复发。一般地，异基因造血干细胞移植的长期无病生存率在70%左右。对于急性白血病等恶性血液病仍然作为一种根治性的手段推荐给患者。
