散瞳对于大多数患者是没有伤害的，但对于个别眼球前房较浅或对散瞳药物过敏的患者，会出现危害。
眼球前房较浅的患者，散瞳后可能会因为眼压快速升高，出现眼红、眼胀、眼痛等不适症状。由于散瞳药物会导致睫状肌麻痹，对药物比较敏感的患者，还会出现看近距离物体不清楚的现象。有的患者还可能会伴随畏光的情况，特别是当光线较亮时，畏光症状会更加明显。
散瞳虽然会对患者的眼睛造成不适感，但大多为一过性的。药效退却以后，这些眼睛不适症状通常会自行消失。为避免不规范检查对眼睛的损伤，患者需要在专业医生的指导下进行散瞳。
