心肌炎包括感染性心肌炎和非感染性心肌炎，病因不完全相同。
感染性的心肌炎，最常见的是病毒性心肌炎，是病毒感染导致的。细菌感染、原虫、寄生虫、螺旋体以及真菌感染等，也可以导致心肌炎。非感染性的心肌炎，和变应原、同种抗原、自身抗原等免疫介导性疾病有关系，也有可能和药物、重金属、生物毒性的物质和物理损伤等原因有关。
确诊患有心肌炎后，应该根据不同的病因，选择药物和方法进行治疗。如果是病毒感染导致的，应该积极的应用抗病毒的药物；和细菌感染有关，要有敏感的抗生素治疗。
