肌张力障碍手术方式要根据具体的病情症状来进行选择，并不是每一种手术方式都对所有的肌张力障碍有效。
如果为单侧的肌张力障碍可以进行丘脑切开术，这样可以阻断从丘脑到额叶运动皮质的异常兴奋传入。
如果为痉挛性斜颈，可以进行硬膜外选择性脊神经后支切断术、前支切断术及副神经微血管减压术等。
如果为扭转性痉挛，可以通过做微电极导向毁损术治疗，除此以外脑深部电刺激术对于改善肌张力障碍也是有明显作用的。不过药物治疗仍然是首选手术，只有在通过药物治疗后达不到效果，或者产生严重的药物副作用导致无法继续药物治疗的病人才进行手术。
