要确定纵隔占位是良性还是恶性，主要是通过病理活检的方法来明确。而给予病理活检主要是通过CT引导下经皮穿刺活检、胸腔镜活检或纵隔腔镜活检的方法进行。
临床上对于纵隔占位这种疾病，通常情况下首先根据病变的影像学特点来给予初步判断，如纵隔内肿块的包膜是否完整、肿块对周围组织器官有无浸润等等，但是这种方法无法给予明确诊断。而给予纵隔占位确诊良恶性主要是通过其病理活组织检查。给予病理活组织检查的方法根据纵隔占位具体的病变部位，可选择CT引导下经皮纵隔肿物穿刺活检、纵隔腔镜活检、胸腔镜活检等方法，将纵隔内病变取出部分组织送病理检查明确诊断。
临床上，一般发现纵隔占位后，无论是良性病变或是恶性病变，一般均建议通过外科手术将病变切除。原因是由于即使纵隔占位为良性病变，由于随着时间的延长，病变可能出现进行性增大后对周边的组织或器官产生明显的压迫，从而导致患者出现不同的临床症状。当切除病变送病理检查明确诊断后，根据术后的具体病理性质，必要时给予其他的相关辅助治疗，如全身化疗、局部放疗、靶向药物治疗等相关治疗来延长患者的生存周期。
