眼睑上的丝状疣，可以通过药物治疗、丝线结扎、钳夹、液氮冷冻、电灼、手术剪除等各种方法治疗。
以局部外涂氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特乳膏、斑蝥素乳膏等药物治疗为主，可以增强局部免疫功能，并且有抗病毒作用，逐渐消除疣体。
对于比较细的丝状疣，可以直接使用医用缝合丝线结扎在丝状疣的基底部，阻断丝状疣的血流供应，使其逐渐坏死、脱落。
可以使用医用血管钳直接钳夹丝状疣的基底部，将丝状疣疣体夹断，在断面涂抹碘伏或碘酊消毒。
可以做液氮冷冻治疗，利用低温作用破坏丝状疣的组织细胞，使丝状疣坏死、脱落。
可以做电灼治疗，利用电灼时产生的瞬间高温作用，使丝状疣的疣体碳化、坏死。
可以直接使用消毒处理了的医用剪刀将丝状疣的疣体剪除，并且对创面消毒、止血。
