睡觉时头疼起床后缓解的原因和治疗方法如下：
有颈椎骨质增生、椎间盘突出、椎间孔狭窄等问题时，如果睡觉时枕头过高或过低，用被褥遮盖口鼻等，都会让脑组织出现缺血和缺氧，造成睡觉时头疼起床后缓解。此时需调整枕头高度，睡觉时避免用被子遮盖口鼻。
脑动脉硬化、高血糖、高血脂、高血压等患者，容易发生局部脑组织的供血和供氧不足，尤其是在睡觉时呼吸频率降低、心率减慢加重缺氧，会引起睡觉时头疼起床后缓解。可使用阿司匹林、舒血宁等药物改善症状。
睡觉时有癫痫发作时，影响神经功能会引起睡觉时头疼起床后缓解。使用抗癫痫药物，如苯妥英钠等等，可以改善症状。
睡眠时间不足或者是睡觉时多梦、易醒、早醒等导致睡眠障碍，使大脑细胞长时间处于兴奋状态，影响神经功能也会出现睡觉时头疼起床后缓解。补充睡眠、适当的头部按摩等处理或者是适当服用地西泮、艾司唑仑等助眠药物可以改善症状。
