扁桃体肿大咳嗽没有应用什么药物最有效的说法，可根据患者情况选择抗炎药、中成药、漱口剂、糖皮质激素类药物、止咳药物等进行治疗。
扁桃体肿大咳嗽常见于急性扁桃体炎，主要病因是溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌感染，需及时应用抗炎药物控制感染。如青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类抗生素，常用药物有青霉素、阿莫西林、头孢呋辛、头孢曲松、罗红霉素等。
扁桃体炎症肿大会引起咽痛、刺激性咳嗽等症状，可应用具有清热解毒、清咽利喉作用的中成药治疗。常用药物有双黄连口服液、甘桔冰梅片、新癀片等。
扁桃体肿大咳嗽的患者可应用具有杀菌作用的漱口剂清洁口腔，缓解咽痛、咳嗽等症状，如复方氯己定含漱液、复方硼砂溶液、呋喃西林漱口剂等。
对于急性扁桃体炎引起的扁桃体肿大咳嗽，可酌情使用糖皮质激素类药物控制炎症，如醋酸泼尼松、甲强龙等。
如果扁桃体肿大继发肺部感染而引起咳嗽，可根据病情严重程度应用止咳药物缓解症状，如甘草片、止咳糖浆、鲜竹沥口服液等。
需要注意的是，上述药物一定要在医生指导下进行，避免自行用药。
