跑完步眼睛疼，可能是由结膜炎、角膜炎、眼疲劳、青光眼等原因引起。
结膜炎多数是由微生物感染所引起，常见的致病菌有金黄色葡萄球菌、淋球菌、肺炎球菌、单纯疱疹病毒、腺病毒等，也可能是寄生虫感染、真菌感染、衣原体感染引起。由于跑完步之后，汗水进入眼内对局部造成刺激，出现眼睛疼，同时还伴有眼睛发红、干涩等症状。一般要给予药物治疗，例如氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、更昔洛韦眼用凝胶等。
角膜炎的发生可能是因为免疫力低下、不良的用眼习惯、感染、全身疾病等因素引起，因为角膜和外界直接接触，很容易会受到外界因素的影响发生炎症反应，由于眼内出现炎症，所以会出现跑完步眼睛疼。一般要给予抗生素类的药物治疗，例如阿奇霉素、头孢克肟、阿莫西林等。
眼疲劳的发生和长时间的不良用眼有很大关系，比如长时间接触电子产品，或者长时间暴露在强光下刺激，都可能会导致眼疲劳发生，眼疲劳的患者也会出现跑完步眼睛疼，同时还伴有流泪、畏光等。平时要注意休息，多做眼保健操，也可以使用人工泪液或者七叶洋地黄双苷滴眼液治疗。
青光眼发病原因比较复杂，可能和心血管疾病、近视眼、年龄因素等有关，跑步属于剧烈运动，所以会导致眼压增高，导致患者出现眼睛疼。一般可以给予盐酸卡替洛尔滴眼液、马来酸噻吗洛尔滴眼液、酒石酸溴莫尼定滴眼液等药物治疗。
