尖锐湿疣是HPV黏膜低危型病毒感染引起的，其中又包括很多亚型。
HPV指人乳头瘤病毒，人乳头瘤病毒大体上分为黏膜高危型、黏膜低危型、皮肤高危型和皮肤低危型，引起尖锐湿疣的病毒是人乳头瘤病毒黏膜低危型。
人乳头瘤病毒黏膜低危型中又包括多种亚型，比如HPV6型、HPV11型、HPV13型、HPV32型、HPV34型等。这些HPV病毒感染后都有引起尖锐湿疣的可能，其中以HPV6型和HPV11型感染引起尖锐湿疣的几率最大。另外，黏膜低危型病毒感染除了引起外生殖器尖锐湿疣外，还有可能引起口咽部和食道黏膜的病变。
黏膜低危型HPV病毒主要通过不洁性行为感染，也可能通过接触被HPV黏膜低危型病毒污染的毛巾、浴巾、马桶套等贴身物品而感染。感染这种病毒后有可能引起典型的尖锐湿疣，也有可能单纯表现为HPV病毒携带状态，或者出现不典型的尖锐湿疣病变，患者或者病毒携带者的皮肤、黏膜细胞内都存在大量的病毒，具有比较高的传染性。
