耳门穴的位置痛常见原因有：颞下颌关节紊乱综合征、外耳道疖肿、急性外耳道炎、先天性耳前瘘管感染等。
颞下颌关节紊乱综合征与关节内外创伤、咬合不良、颞下颌关节负荷过重、精神紧张有关，会导致耳门穴位置及其周围疼痛，特别是张口或进行咀嚼时症状明显。也可出现关节弹响、下颌运动受限等症状。
外耳道疖肿属于急性感染性疾病，外耳道皮肤较薄，皮下软组织较少，皮下软骨附着，疖肿会导致软骨疼痛，如果波及耳门穴处，就会引起耳门穴的位置疼痛。急性期还可伴发热、乏力等症状。
急性外耳道炎特别是弥漫性外耳道炎，为外耳道的弥漫性炎症病变，导致外耳道皮肤弥漫性红肿，外耳道内分泌物积存，耳周肿痛不适，会引起耳门穴的位置疼痛。
耳前瘘管的开口位于外耳皮肤上，多见于耳轮脚前，离耳门穴位置较近。当先天性耳前瘘管发生急性感染时会引起局部疼痛，严重者出现脓肿或破溃形成脓瘘。
如果发现耳门穴位置疼痛，应尽早就医，查找病因并对因治疗。
