儿童癫痫与夜惊的区别主要是发作机制和发作时间不同。
儿童癫痫与夜惊最主要的区别是夜惊发作时脑电图检查无异常波形。夜惊常常于夜间患儿熟睡时发生，其发作时临床表现为睡梦中突然坐起、大喊大叫、大汗淋漓、呼吸脉搏加快，如同做噩梦一般。随着年龄的增长夜惊症状可逐渐消失。
儿童癫痫主要是因为大脑神经元细胞一过性同步放电，导致机体肌张力改变，可出现四肢肌张力增高、痉挛等，也可表现为失神发作，在较短时间内可以自行缓解，行脑电图检查往往可以见到异常波形，确诊后需要服用抗癫痫药物治疗。
