肛周脓肿手术的大小需根据脓肿范围、位置及患者就诊时间决定。
早期肛周脓肿范围较小，手术时间大约10分钟，此时手术相对较小；深部直肠周围脓肿，如坐骨直肠窝脓肿，脓肿巨大，引流脓液量可达300-500ml，此时患者伴有全身高热、寒战等症状，手术时间相对较长，且后期需进行2-3次手术治疗肛瘘等，手术相对较大。
此外，巨大脓肿对肛门部结构影响较大，在手术引流中，要注意避免损伤肛门的括约肌或者肛管直肠环。由于肛周脓肿治疗不及时或者反复迁延不愈容易导致肛瘘的形成，所以及时的治疗可以预防术后相关并发症的发生。术后增加饮食营养，增加高蛋白的食物，促进创面的愈合。
