一般情况下，自身免疫性肝炎预后如何与个人体质和病情严重程度有关。
若患者体质强健，病发时出现乏力、恶心、呕吐、黄疸等症状，但症状较轻，一般预后良好。可在医生的建议下使用醋酸泼尼松、硫唑嘌呤等药物抑制免疫反应，可有效缓解各项症状，达到治疗目的。
反之，若患者体质虚弱，病发时各项症状严重，药物治疗后得不到有效缓解，更甚者患者可能会出现病情发展过快的情况，最终引发肝硬化，肝硬化是肝脏不可逆的损伤，无法治愈，此类情况为预后不佳，可考虑行肝移植治疗。
