性器官包括外生殖器和内生殖器，男性外生殖器包括阴囊和阴茎，内生殖器包括睾丸、附睾、输精管、精囊、前列腺等。前列腺癌根治术不会切除阴囊和阴茎，其切除的部位主要包括整个前列腺、精囊、部分输精管、部分尿道和男性射精相关的器官。
由于精囊、部分输精管和男性射精的相关结构被切除，所以前列腺癌根治术后的患者会丧失射精功能以及射精时的快感。
阴茎勃起神经和前列腺伴行，对于分期分级比较低的患者，临床上可采取保留该神经的前列腺筋膜内切除技术，术后患者勃起功能受到的影响较小。但对于不适宜保留该神经的患者需要随前列腺一并切除，这部分患者术后会丧失勃起功能，
