胆汁反流与胃食管反流的区别在于发病原因和反流到的部位、反流物的性质、及临床症状等不同。
胆汁反流的发生主要与胃部手术后幽门缺失，以及幽门变形、无力胃、胃下垂、焦虑、抑郁等导致的幽门括约肌功能障碍，肠系膜上动脉压迫综合征等有关，以致胆汁反流至胃内。胃食管反流病的发病，主要是因为贲门松弛、食管下段蠕动功能紊乱，食管裂孔疝、胃排空障碍等多种原因，导致胃内容物反流进入食管，但胃食管反流病多数合并胆汁反流。
胆汁反流的反流液主要是十二指肠液，十二指肠液的成分以胆汁为主，偏碱性。胃食管反流的反流物主要是胃内容物，含有大量的胃酸，偏酸性，但部分胃食管反流合并胆汁反流，可以出现混合性反流。
胆汁反流患者的典型症状主要以左上腹部胀痛、胃部烧心为主。胃食管反流的典型症状以胸骨后烧灼痛、反酸等为主。
