子宫内膜异位症比较典型的症状是继发性痛经、进行性加重。
子宫内膜异位症导致的痛经，疼痛的部位多为下腹部、腰骶部以及盆腔中部，有时还可能放射到会阴部、肛门及大腿。痛经的症状一般发生在月经来潮前，整个经期会持续存在。子宫内膜异位症导致的疼痛程度，和病灶的大小不一定成比例。比如盆腔内比较小的散带病灶，疼痛有可能难以忍受。
有27~40%的患者，没有痛经的症状，所以痛经不是诊断子宫内膜异位症必需的症状。
子宫内膜异位症不孕的几率可以达到40%，引起不孕的原因是比较复杂的。
