质子治疗脊索瘤是有效果的，至于效果如何，这存在个体差异，有一部分人的效果比较好，也有一部分人效果要差一些。
质子治疗脊索瘤就是通过质子刀采用大剂量的分割治疗，这是属于放射外科的治疗方法，主要是针对于手术以后的残余肿瘤组织，通过质子刀治疗能够杀灭部分肿瘤细胞，从而可以起到延缓肿瘤发展和复发的作用，但是这种方法也起不到治愈脊索瘤的功效。
脊索瘤治疗是非常困难的，治愈率非常低，并且预后差，5年生存率也不足50%，主要的治疗方法包括手术以及伽玛刀、质子刀等，进行综合的治疗效果可能更好一些。
