儿童功能性消化不良主要的症状为上腹部疼痛、早饱、腹胀、厌食、嗳气、恶心、呕吐。其次，还可伴随上腹部烧灼感和反酸。疾病发展至后期时，可出现身体以及智力发育延缓，甚至可造成精力不足、注意力不集中，部分患儿可产生精神心理障碍，如焦虑、抑郁、烦躁等。
功能性消化不良和多种因素有关，例如饮食、环境、幽门螺旋杆菌感染、消化道运动功能异常、心理因素等。功能性的消化不良应根据患儿的症状进行对症治疗，若存在长时间焦虑、抑郁、烦躁，还应该在医生指导下配合心理治疗。
