桥本甲减在治疗时要根据患者的具体情况和甲减的程度选择治疗方案。
如甲状腺激素水平正常，仅促甲状腺激素水平升高，为亚临床甲减，当TSH小于10mIU/L，属于轻度亚临床甲减，对于桥本氏甲状腺炎的轻度亚临床甲减患者，倾向于给予左甲状腺素替代治疗，如有妊娠要求，则必须进行治疗。
对于TSH大于等于10mIU/L的患者，属于重度亚临床甲减，主张给予左甲状腺素替代治疗。
而对于桥本患者甲状腺激素水平下降，促甲状腺激素水平升高者，属于临床甲减，需根据患者的年龄、体重和心脏功能状态等情况制定初始用药剂量，之后复查甲功，调整药物的用量，直至甲功恢复正常，一般需要长期进行左甲状腺素替代治疗，保持甲功在正常范围内。
