颅内胶质瘤手术之后可能会遗留下后遗症。由于颅内胶质瘤与正常的组织没有明显的边界，而且往往在肿瘤与正常组织的交界处都有肿瘤细胞存在，因此在手术切除胶质瘤的过程中，不仅要切除肿瘤实体，在可能的情况下还应连带周围的水肿组织也一并切除，可能会对正常的脑组织产生损伤，因此在胶质瘤手术后，往往可能留下不同程度的后遗症。
手术的区域不同后遗症有所差异，如额叶胶质瘤，手术后患者可出现记忆力减退、计算能力下降以及反应迟钝等，高级智能障碍。若为颞叶的胶质瘤，术后患者则可表现为癫痫发作。若为顶叶胶质瘤，术后患者常可出现对侧肢体的感觉异常。若为枕叶胶质瘤，术后则可出现视力以及视野改变等。
