虽然子宫肌瘤多数为良性肿瘤，但也是有可能发生癌变的，发生率大概是0.5%。
子宫肌瘤会变性，包括玻璃样变、囊性变、红色变性、肉瘤样变以及钙化。其中肉瘤样变是指子宫肌瘤发生恶变，针对于绝经后女性。如果子宫肌瘤没有萎缩反而进一步增长，需要高度警惕恶变可能。另外，即使是育龄妇女，如果短期内子宫肌瘤增长迅速，也要警惕恶变可能，肌瘤恶变后组织变脆且硬，切面呈灰黄色，似生鱼肉状，需要通过病理检查加以明确。
如果考虑子宫肌瘤有肉瘤样变，主要以手术切除为主。没有生育要求者，经评估后需要行子宫以及双侧附件切除，以预防癌细胞的转移及扩散。
