多数情况下，甲状腺滤泡囊肿是不严重的，但有少部分是严重的。大部分的甲状腺滤泡囊肿是由于缺碘导致的，一般不会有严重的症状。如果滤泡囊肿比较小，动态观察即可，不需进行特殊的处理。另外，有些患者囊肿会伴随结节，如果是良性结节也是不严重的。但也有部分患者的甲状腺滤泡囊肿会逐渐增大，并且会对周围组织器官造成压迫出现声音嘶哑等症状，这种情况下要考虑手术切除。对于滤泡囊肿伴随恶性结节，即使滤泡囊肿小，也需要采取手术治疗，这两种情况是比较严重的。
