胃间质瘤严重程度是根据肿瘤的大小、核分裂、原发肿瘤的位置进行划分的。一般划分以下几个组：极低风险、低风险、中风险、高风险。肿瘤小于2cm且核分裂数小于5的，一般为极低风险组，良性可能性极大，定期复查胃镜等相关检查，一般不需要手术治疗。肿瘤大小在2-5cm之间，核分裂数小于5，一般属于低风险组，可以选择微创手术治疗。肿瘤体积大于10cm，核分裂数大于10，属于高风险组，需要手术治疗，术后需要应用酪氨酸酶抑制剂控制肿瘤复发，延长患者生存期。也可以在手术前应用，缩小肿瘤体积，提高手术成功率。
