早起后头晕，可能是早起后低血糖、血压波动幅度较大、位置性眩晕等导致的。大脑能量来源主要是来自葡萄糖的直接供能，机体在夜间消耗能量后，可能会造成早起低血糖的状态，造成颅脑营养供应不足，产生起床后头晕。其次，血压具有自我昼夜节律调节的功能，一般在凌晨血压下降比较低，在早晨清醒后，血压会急剧升高，波动幅度较大的血压变化可能会引起不适、头晕的症状。此外，早起时位置发生变化，可能诱发前庭功能异常发生眩晕，多见于良性阵发性位置性眩晕患者。
