无论是第三天的胚胎移入到子宫腔或者是第5天的胚胎植入子宫腔，虽然胚胎和子宫内膜之间发生分子学上的对话产生定位黏附，侵入到子宫内膜完成着床，这一阶段跟正常怀孕一样。
母体一般没有什么明显的不适，自然怀孕的女性饮食起居正常，因而没有什么反应。而胚胎移植后的女性会因为受到家人的关注，因为需要服用保胎的药物或者打保胎的针，有的人会高度紧张焦虑、焦虑激素分泌增加而导致子宫的收缩，会感到下腹坠痛不适，胚胎着床的本身一般没有什么不良反应，一旦发生着床以后，有的会出现少量的阴道流血，这就是内膜突破性的出血。
移植后14天着床完成以后，到下次月经来潮前会有点疼痛不适，一般是盆腔充血造成的，类似要来月经的感觉。
