尿路感染的并发症较多，常见的有肾乳头坏死、肾周围脓肿以及感染性肾结石等。
肾乳头坏死通常好发于伴有糖尿病，或者尿路梗阻的肾盂肾炎患者，主要症状表现为发热、寒战、剧烈的腰痛以及血尿，属于比较严重的并发症，当有坏死的组织脱落，从尿中排出，会阻塞输尿管而出现肾绞痛。
肾周围脓肿与糖尿病、尿路结石等易感因素有关，主要为严重的肾盂肾炎直接扩展而至，在原有症状的基础上可出现明显的单侧腰痛。
感染性肾结石通常是由感染形成，属于一种特殊类型的结石组成部分，包括磷酸、磷灰石和磷酸镁胺等。
尿路感染如果治疗及时，一般出现的并发症很少，如果治疗不及时，除了以上并发症以外，还可能会出现慢性膀胱炎症、排尿异常、慢性肾盂肾炎等并发症。
