儿童自闭症主要是一种神经发育障碍，目前形成的原因不清楚，考虑与遗传有很大的关系。
儿童自闭症一般情况下见于小儿，主要是在发育过程中出现的异常。如果家庭成员中有孤独症患者，后代发生孤独症的概率会明显的增加。
某些染色体病变可以导致孤独症，一些头部结构和生理改变也会导致孤独症，家族有遗传史，男孩或者同卵双胎也会增加患有孤独症的几率。一些孕期高危因素，例如孕妇用药、孕妇合并糖尿病或者高血压等疾病，胎儿本身的问题，例如胎位不正、出生体重低都可以导致孤独症，父母年龄过大也会导致孤独症。孤独症很可能是多种因素相互作用导致的一种疾病。
