再生障碍性贫血主要表现为骨髓造血功能低下、全血细胞减少和贫血、出血、感染综合征，另外，不同类型的再生障碍性贫血有不同的症状，具体如下。
重型再生障碍性贫血起病急，进展快，病情重。贫血呈进行性加重，乏力、心悸等症状明显；多数患者有发热，体温在39℃以上，以呼吸道感染最常见，感染菌种以革兰阴性杆菌、金黄色葡萄球菌和真菌为主，常合并败血症。均有不同程度的皮肤、黏膜及内脏出血。深部脏器出血时可见呕血、便血、血尿、眼底出血、颅内出血等，后者常危及生命。
非重型再生障碍性贫血起病和进展较缓慢，病情较轻。贫血为慢性过程，输血后症状改善，但不持久。感染相对易控制，很少持续1周以上。出血倾向较轻，以皮肤、黏膜出血为主，内脏出血少见。
