对于家族性肥厚型心肌病的患者，在治疗时多会选择药物进行治疗，多会选择β受体阻滞剂、血管紧张素转换酶抑制剂、利尿剂、二氢吡啶类钙通道阻滞剂等类的药物。使用药物进行治疗，主要是为了改善患者所出现的不适症状，降低对心肌细胞的损伤。
另外，有些患者也可以选择手术治疗，一般多会选择无水酒精消融或者是外科手术治疗。
对于家族性肥厚型心肌病的患者，具有家族遗传倾向，一般多发生于青年人群，没有很好的治疗方法，只能够通过治疗改善症状，控制病情发展。
