肾小管间质性肾炎需要找出原发疾病，进行对症治疗。
如果认为患者是药物相关的急性肾小管间质性肾炎，应先停用正在使用的药物，并且以后不要再使用这类药物；如果患者停药后肾功能仍未恢复，则需考虑使用糖皮质激素进行治疗；如果使用糖皮质激素后肾功能仍未恢复，将酌情使用免疫抑制剂进行治疗。
如果急性肾小管间质性肾炎是感染引起的，患者需要积极进行抗感染治疗，没有明显效果时可以注射糖皮质激素；如果考虑自身免疫引起的急性肾小管间质性肾炎，需要进行免疫抑制治疗。
