输尿管损伤的原因主要包括外伤性损伤和医源性损伤。
外伤性损伤常见的有贯穿性损伤，比如枪伤或锐器刺割伤。另外包括非贯穿性损伤，多发生于高处坠落以及车祸。
医源性损伤包括手术损伤、检查器械损伤以及放射性损伤，具体如下：
其中手术损伤见于下腹部或者盆部手术，以妇科手术最为多见。
检查器械损伤多见于套石及输尿管镜检查等，可导致输尿管撕裂或者穿孔。
放射性损伤是指使用高强度的放射性物质，而引起输尿管以及周围组织充血、水肿以及炎症。最后因局部瘢痕纤维化粘连而引起狭窄。
