与肝脓肿这种疾病相诊断鉴别的有右侧膈下脓肿、胆道感染、肝内胆管细胞癌等疾病。
临床上对于肝脓肿这种疾病，主要有细菌性肝脓肿和阿米巴性肝脓肿两种。两种疾病的致病菌分别为细菌和阿米巴滋养体。
而本身两种不同类型的肝脓肿需要鉴别诊断外，还需要和右侧的膈下脓肿、胆道感染、肝内胆管细胞癌、肝囊肿等疾病相鉴别。其鉴别的方法根据和哪种疾病相鉴别，可选择增强CT、彩超引导下诊断性穿刺等方法来加以鉴别。
一旦确诊为肝脓肿后，应根据具体类型选择相应的药物或手术来治疗。
