一般情况下，肝囊肿直径大于5厘米可以考虑手术治疗。
囊肿直径大于5厘米，一方面容易发生破裂出血，可能导致患者出现突然腹部疼痛，诱发急腹症出现；另一方面，囊肿较大还会压迫肝脏，从而诱发肝区疼痛，出现恶心呕吐、消化不良等消化系统症状。建议及时手术治疗。
如果患者由于寄生虫感染囊肿病变发生，可以在使用驱虫药物治疗的同时，监测囊肿变化。对于出现临床症状的患者，建议及早手术，不一定要囊肿特别大才手术，从而降低病变对患者的影响。
如果囊肿比较小，就要结合患者实际情况分析。对于临床症状不明显的患者，建议定期随诊复查。通过B超等检查项目，监测病情发展。
