膀胱菜花状肿瘤有良性，也可有恶性。单纯地根据膀胱肿瘤外观，无法准确判断疾病的良恶性质，病理学检查才是“金标准”。
通常菜花样膀胱肿瘤多为恶性，但是最终诊断仍需要依靠病理检查，可以通过膀胱镜下活检或者诊断性电切肿瘤，获得组织后进行病理学检查，是最可靠的方法，此项检查可明确肿瘤的大小、数目、形态以及生长情况，还可明确与周围正常组织的关系。
此外还可进行尿液细胞学检查，但此时应注意需要与膀胱镜以及影像学检查配合，降低漏诊率。
通过相关检查，若为良性的肿瘤，可根据大小、位置决定具体的治疗措施。若为恶性的肿瘤，对于早期的膀胱恶性肿瘤，通常建议手术治疗，术后大多数的患者需要配合医生进行综合治疗。
