生殖器疱疹分为初发性生殖器疱疹和复发性生殖器疱疹。初发性生殖器疱疹的典型症状为外生殖器或肛门周围有群簇或散在的小水疱，2-4天后破溃形成糜烂或溃疡，同时出现瘙痒和疼痛等症状。可伴有腹股沟淋巴结肿大，伴压痛。患者还可以有发热、头痛、乏力等全身症状，病程一般要2-3周。
复发性生殖器疱疹表现为原发皮疹消退后反复发作，起皮疹前局部常有烧灼感、针刺感或感觉异常,1-5天后外生殖器或肛门周围出现成簇小水疱，很快破溃形成糜烂或浅溃疡，自觉症状较轻，皮疹范围一般比原发感染者小。
