胃脂肪瘤有恶变的可能，但恶变概率非常小。
从肿瘤的病理性质来说，胃脂肪瘤属于胃间质瘤的一种，是一种比较常见的良性肿瘤。因为胃间质瘤具有潜在恶变倾向，所以胃脂肪瘤同样也有恶变的倾向，但是胃脂肪瘤本身的发展速度非常缓慢，恶变的概率很低。明确诊断后如果能够及早进行手术治疗，通常都可以完全治愈，基本上不影响患者的自然寿命。
只有极个别患者，出现胃部症状后不及时就医，没有能够及时检查出来胃脂肪瘤、或者检查出来后没有引起重视，病变组织长期存在，才有可能出现恶变的现象。
