第三脑室肿瘤可以选择手术治疗或者配合放疗和化疗。
第三脑室肿瘤容易引起脑室周围组织的压迫，从而引发神经功能障碍。最主要的治疗方法为手术切除肿瘤，常用的手术方式，有神经内镜切除术，适合于良性的肿瘤患者，所产生的创伤会比较小。
也可以使用显微直视手术或者显微直视手术加神经内镜辅助手术，要对肿瘤进行辨别，要清除周围的组织结构，尽可能完全切除肿瘤，同时要保留周围神经组织的功能，防止产生后遗症。
如果术后有出现肿瘤组织残留，可以选择放疗和化疗的方法综合处理。
